Император Внеземелья Шао Кан прибывает на Землю, чтобы лично предупредить ее жителей о своих намерениях: уничтожить мир земной, и сделать все это за семь библейских дней. В числе его подручных - роботы, обладающие инстинктами и приемами ниндзя, четырехрукая дева Шива и звероподобный человек Мотарро. Но им противостоят герои Земли во главе с самим лордом Рейденом... Ожидается фейерверк единоборств!
В фильме Смертельная битва 2: Истребление снимались
Из-за проблем со временем и бюджетом многие из актёров и каскадёров сыграли в картине по нескольку ролей.
Кристофер Ламберт, игравший Рэйдена в первом фильме, хотел сыграть его и во втором, но в это время был занят на съёмках «Беовульфа» (Beowulf, 1999). Крису Касамассе, исполнителю роли Скорпиона в первой части, тоже предлагали продолжить путь своего героя во второй серии, но тот предпочёл работу в «Бэтмене и Робине» (Batman & Robin, 1997).
Роль Джакса первоначально предлагалась Майклу Джею Уайту, но он отказался от неё в пользу главной роли в «Спауне» (Spawn, 1997).
Роль Бараки предлагали Сильвестру Сталлоне. Он отказался.
Джейд не была злодейкой, наоборот в игре она была лучшей подругой и телохранителем Китаны. А вот её действия, связанные с соблазнением Лю Кана, были скопированы с действий Тани, работавшей на Шиннока в игре Mortal Kombat 4. Но так как фильм связан с третьей игрой, вместо Тани Лю Кана соблазняет Джейд.